一项对野生和孵化银鲑鱼遗传谱的新研究表明,这两种鱼类在形成交配对方面存在重要区别。
俄勒冈州立大学研究人员的这些发现为野生鱼和孵化鱼之间的细微差异提供了新的见解,这些差异可能导致孵化鱼交配方式发生变化,以促进孵化鱼的成功并保存和保护野生鱼。
“基因可以为我们提供使用人类感官无法感知的洞察力。我可以看到大小和颜色的差异,但基因为我们提供了关于我们看不见、听不到或感觉不到的东西的信息,”俄勒冈州立大学沿海俄勒冈海洋实验站的博士后研究助理、该研究的负责人希瑟·奥尔德 (Heather Auld) 说。作者。
“如果我们能够更多地了解天然鱼类如何在野外交配,如果这与孵化场鱼类在野外交配的方式不同,我们就有可能收集新信息来改进孵化场应用的交配策略。”
研究人员的发现最近发表在综合有机生物学杂志上。
由于过度捕捞、污染、与淡水栖息地相关的其他损失以及与气候变化相关的恶劣海洋条件,美国濒危物种法将野生银鲑鱼列为受威胁物种,包括俄勒冈海岸沿线和哥伦比亚河下游.
40 年前,为增加丰度所做的努力主要集中在生产孵化场鱼,但事实证明,野生鲑鱼的繁殖能力优于孵化场的鲑鱼。研究人员还发现,孵化场产生的鱼可能对野生鱼及其繁殖能力产生负面影响。
“已经在四种鲑鱼物种中证明,在野外繁殖的孵化鱼不如野生鱼那么有活力。如果它们与野生鱼类繁殖,野生鱼类产生的后代数量就有减少的风险,”合著者迈克尔班克斯说,他是俄勒冈州立大学渔业、野生动物和保护系渔业基因组学、保护和行为教授科学和俄勒冈州沿海海洋实验站位于俄勒冈州立大学哈特菲尔德海洋科学中心。“我们现在正在努力寻找一种方法来制作更好的孵化鱼,而不会对野生鱼产生下降影响。”
研究人员利用从鳍夹收集的遗传物质进行基因型测序,扫描单个鱼的整个基因组以获取特定标记并进行分析,以揭示数百条野生鱼和孵化鱼的遗传图谱。
他们发现孵化场和野生鱼都倾向于表现出负面的分类——这意味着他们寻找与自己不同的配偶,在遗传上。班克斯说,负分类是交配中的常见发现,因为差异交配是提高对疾病抵抗力的一种方式。
但研究人员发现孵化鱼和野生鱼在不同的遗传标记上表现出负面分类。虽然研究人员已经确定了这些差异,但他们仍然对许多与负分类相关的基因知之甚少。
“我们不知道这些基因的结果是什么,”奥尔德说。“我们知道有些可能与神经发育有关,有些可能与行为有关,但我们不知道它们的具体特征在鱼中是如何呈现的。”
利用这项研究和先前工作的信息,研究人员现在正试图更好地模拟孵化场环境中银鲑鱼的自然交配。研究人员在俄勒冈州桑迪河的支流雪松溪的桑迪孵化场工作,从已经返回产卵的鱼身上收集组织样本,然后试图找到与野生鱼中发现的相似的基因匹配。
对于每个雌性,他们将鸡蛋分成两批。一半的卵由随机选择的雄性受精,这是孵化场的典型做法;另一半与根据在自然环境中野生鱼类交配时观察到的遗传谱信息选择的“最佳”雄性进行受精。
班克斯说:“我们正在尝试模仿自然的定向繁殖。”“这不是一个简单的壮举,因为我们从大自然中观察到,大多数基因与选择不同的配偶有关,但也有一些基因与选择相似的东西有关。我们不熟悉在同一交配决定中同时调用不匹配和匹配策略的其他育种尝试。”
研究人员与定量生命科学中心的生物信息学分析师 Dana Gibbon 合作开发了一种新的计算机算法,称为 MultiFaceted CHOICE,为到达产卵台的雄性和雌性提供最佳选择。
在为期三年的实验的第三年,研究人员将很快返回孵化场再次交配鱼。这也是他们期望在实验的第一年遇到第一批返回的鲑鱼或年轻的雄性鲑鱼的第一年。
奥尔德说:“今年一些千斤顶将开始回归,我们预计从明年秋天到 2025 年的所有回报都将来自我们的实验。”“在此期间,我们将继续采集基因样本,以确定这一过程是否成功。
“根据我们的发现,这可能会改变我们与孵化鱼交配的方式。而且可能会导致孵化鱼更像野生鱼类,对野生鱼类的影响较小。”