人类社会全面进入物联网时代，作为物联网的重要分支农业物联网将给人们的生活方式带来较大的改变。在农业物联网的世界里，每一样农产品都具有过程的记录。农业物联网的建立能够为食品安全提供保障，可以清楚知道食品产地、种植过程、农药使用、加工及流通全过程。但由于农业物联网是一种虚拟网络与现实世界实时交互的新型系统，其无处不在的数据感知，无线为主的信息传输、海量的数据存储，智能化的信息处理，无所不在的连接，使得人与农产品都成为农业物联网中的一个最重要的节点，通过网络进行交流。
正因如此，农业物联网带来了较多的安全问题、隐私问题、数据保护问题、资源控制问题，及涉及社会多个层面的道德伦理问题。在整个网络中，有一处漏洞就会产生较大的危害，毒感染、资源滥用等新型问题进入一个全新时代，这是传输过程中的问题，该问题不仅农业物联网存在，所有类型的物联网也同样面临。农业物联网与其他物联网最大的差别是，农业物联网能够较大程度地保证农产品生产过程中的各类生产信息的公开，而且使用农业物联网进行生产的农产品附加值较高，但部分数据的录入在目前还没有相应的传感器( 或者传感器价格太高难以实现产业化) 进行检测的技术条件下仍然采用人工录入的方式，使农业物联网的信息提供在某种程度下难以全部保证真实准确，部分不法农产品加工商可能利用该漏洞进行错假数据的录入，或者使用从农业物联网上获取的合格农产品信息，使不合格的农产品以安全的信息流入市场; 同时，农业物联网也进一步拓宽了非法获取个人信息的渠道，给个人隐私的保密带来更大的困难。
农业物联网可以给互联网带来大量数据，尤其是农药使用等数据的真实性问题，这是农业物联网伦理问题的根源。同时在农业物联网中，与之相关联的农产品生产企业及农业从业人员数据，也将随着其他物联网一起，形成更为广泛的物联网，每个农业企业的经营信息都将随时随地连接在这个网络上，随时随地被感知，在这种环境中如何确保信息的安全性和隐私性，防止个人信息、农业业务信息和农业生产企业经营信息被他人盗用，将是农业物联网推进过程中需要突破的重大障碍之一。
农产品结合个人数据在商业用途上是非常有价值的。以物联网中最重要的标识技术之一二维码技术为例，带有二维码的农产品在售出之后仍然可以工作，第三方的阅读器就可以对其扫描，并编辑这些标签发出的数据，把这些数据整合在一起，就能全面了解消费者本人，包括收入、健康状况、生活方式，甚至饮食习惯，用于农产品市场营销的目的或客户关系管理数据库。近几年网上购物成为潮流，低成本的网络搜集的消费者详尽而准确的信息，可以使农产品生产商和销售商有的放矢，甚至可以让销售商采用有差别的价格，把无差别的安全农产品卖给不同的顾客，更甚者将不安全的农产品贴上安全标示销售给不同价格期望的顾客。
不管是应用何种手段在农业物联网上非法获取个人信息和农业信息，最终所反映的伦理问题集中在各种隐私信息是否授权传输与使用上，反应到具体的使用人身上，不管哪种方式，都通过科技手段将这些问题进一步曝光与激化。
农业物联网作为一种科技手段，从正面上来说是进一步提高农产品生产过程信息的公开化，但到底是帮助人类进一步理清伦理道德问题，还是将该问题进一步恶化，目前还不能定论。当农业信息技术和网络进入社会化应用之时，特别是农业物联网将进一步丰富个人信息非法获取途径的情况下，不仅自然社会的许多相关情况和道德问题会同步出现在网络与信息交互中，而且还将对人民普遍恪守的伦理道德底线进行冲击。而从科技和社会发展的历程上看，特别是"默多克危机"的发生，对于保护个体隐私这一观念的保护和强化，"捍卫个人隐私是底线伦理"已经逐步成为普世价值，科技手段并不能改变人类普世价值的认可，反而将普世价值更加深入，捍卫这一价值的力量主要来自于人类对一些基本伦理的恪守。
