由生物科学系助理教授 Nalini Puniamoorthy 领导的新加坡国立大学 (NUS) 的一组研究人员开发了一种综合方法,可提高蚊子监测和管理的准确性。
许多媒介传播的疾病是通过吸血的苍蝇传播的,例如蚊子。了解此类疾病的传播风险需要了解该地区的潜在媒介,包括有关媒介多样性和丰度的信息。在他们的研究中,研究人员证明了标准蚊子群落监测方法和识别技术的局限性,这些方法和识别技术会导致不同栖息地的蚊子群落结构的不准确反映。
为了解决这个问题,研究人员采用了一种综合方法,包括一种两管齐下的策略,通过包括蚊子幼虫来提高采样的准确性,并使用由高科技下一代测序 (NGS) 生成的短 DNA 序列(称为迷你条形码)进行物种鉴定。 ) 平台。增强的数据准确性可以减少生态研究和媒介监测的下游分析中的错误级联。这种方法也可能适用于其他具有医学意义的吸血苍蝇,例如叮咬蠓和白蛉。
研究结果于 2021 年 8 月 5 日发表在《应用生态学杂志》上。
通过提高数据准确性来减少错误级联
蚊子多样性的传统估计通常基于针对寻找宿主物种的成年雌性诱捕方法。然而,由于忽视了幼虫阶段,这些可能代表了一个地区蚊子群落结构的有偏见的快照。
与仅包含成虫数据的样本相比,在新加坡的各个野外地点包括蚊子幼虫采样后,总体多样性估计值提高了 38%。增强的估计有助于了解新加坡潜在媒介的基线知识,因为在其他国家发现其中一些蚊子物种携带各种病原体。采样幼虫还有助于在幼虫阶段对蚊子进行有针对性的管理。
由于不同物种之间的物理相似性以及单个物种内部的差异,使用基于外部特征的传统监测方法识别蚊子也构成了挑战。该小组采用的采样方法来同时定位成虫和幼虫的蚊子的多种,并且证实,使用小型条形码可以分化物种如甲EDES(Downsiomyia),按蚊barbirostris复杂和库蚊(Lophoceraomyia) 仅凭成人外表很难识别。新加坡国立大学的研究人员是第一个成功地在蚊子上使用迷你条形码的人,并展示了它在减少物种估计中的错误识别方面的效用。他们的结果导致更准确的物种多样性报告和媒介控制工作的促进,特别是对于医学相关的昆虫群体。此外,与标准监视方法不同,可以使用迷你条形码处理和识别损坏的样本。
驾驭支离破碎的景观
“新加坡快速的城市化和土地利用变化导致了高度分散的景观,增加了森林和人口稠密的城市空间之间的接触区。我们的方法在增强对不同物种的多样性和组成的理解方面起着至关重要的作用,并有助于促进早期预警检测和设计合适的管理策略,” Nalini 助理教授说。
她和她的团队计划通过观察蚊子的生殖特征来研究疾病是如何通过蚊子传播的。具体来说,他们正在使用种群基因组学工具来研究发生在城市空间等环境中的物种迁移,以及那些主要发生在森林中但可能由于栖息地丧失而侵入半城市环境的物种迁移。
研究人员还计划进一步研究使用 DNA 条形码和工业应用的集成方法来扩大物种识别能力。